早筛查,早诊疗,向“为时已晚”说拜拜!
复旦大学附属华山医院消化科团队在生物分析化学杂志Talanta发表了题为“Developing Slow-off Dickkopf-1 Aptamers for Early-diagnosis of Hepatocellular Carcinoma”的文章,该团队开发了针对Dickkopf-1的慢解离核酸适配体,可配合抗体形成核酸适配体-靶标-抗体的HCC早期筛查ELISA方法,进一步降低筛查成本,提高筛查的效率。在筛选与改造过程中,Biacore为核酸适配体的筛选指标提供了关键数据。
研究人员在以指数富集的配体系统进化技术(Systematic Evolution of Ligands by Exponential Enrichment,SELEX)对DKK1核酸适配体文库筛选后,使用Biacore T200将DKK1固定在CM5传感器芯片上,并将候选适配体作为分析物进行亲和力/动力学检测。如图1、2、3及表1所示,筛选获得的三类核酸适配体D5/D10/D17与DKK1的KD分别为12.26nM、24.85 nM、21.81 nM,均在同一数量级,而三者的解离速率却大有不同,其中D10的kd值是D5和D17的10倍。与快速解离的核酸适配体相比,慢解离的适配体可以大大降低基于适配体的临床ELISA检测的假阴性,极大地提高了HCC早期筛查的准确率与效率。
候选核酸适配体D5(图1 )、D10(图2)与DKK1的亲和力/动力学传感图

基于对核酸适配体D10的检测结果,对DKK1核酸适配体文库进一步进行慢解离筛选,获得适配体D10的突变体C29T,及C29T基础上34位缺失的34del。研究人员使用Biacore以及上述已固定DKK1的CM5传感芯片,以C29T、34del作为分析物,对全新的候选适配体进行亲和力/动力学检测,结果如图4、5及表2所示。候选核酸适配体C29T与34del的KD分别为8.062nM、371.9 pM,比适配体D10的亲和力提高了3.1倍和66.8倍。除此之外,适配体34del的kd已经达到了7.374×10-5s-1,获得了极慢解离的核酸适配体。在对其进行结构预测后,证明截短序列可以进一步提高结合能力,并在其基础上进一步截短,获得全新优化的核酸适配体TD10,将其用于后续HCC筛查。
候选核酸适配体C29T(图1)、34del(图2)与DKK1的亲和力/动力学传感图


在助力核酸适配体筛选之余,Biacore也同样助力各类不同癌症早筛方法的建立。
- 日本千叶县癌症中心的研究团队,使用Biacore发现KRAS5可以作为特异性富集因子,富集ctDNA中的KRAS突变,并使用dPCR进行检测,大大提高了筛查灵敏度,在早期ctDNA水平较低的情况下,建立了结直肠癌患者的早期筛查和诊断方法。
- 日本东部国家癌症研究中心的研究团队,使用Biacore发现了组织因子(TF)的单链抗体,可以作为免疫探针,配合MRI、PET等分子成像技术,实现对胰腺癌、胃癌、脑癌等各类实体瘤的早筛。
- 加州大学洛杉矶分校的研究团队,使用Biacore开发了一种针对唾液样本的直接检测方法,通过使用抗体三明治法对样本中的IL-8进行检测,仅需13分钟即可得到结果,为口腔鳞癌患者的早筛提供了极大的便利。
- 澳大利亚格里菲斯大学的研究团队就使用Biacore开发了一种临床样本的直接检测方法,使用该方法检测乳腺癌患者的血清样本,确定了Neu5Gc是乳腺癌筛查与监测的重要生物标志物,为乳腺癌早筛提供依据与方法。
参考文献:
[2] Enrichment technique to allow early detection and monitor emergence ofKRASmutation in response to treatment[J]. Scientific Reports, 2019, 9(1).
[3] Sato R , Obonai T , Tsumura R , et al. Preparation and characterization of anti-tissue factor single-chain variable fragment antibody for cancer diagnosis[J]. Cancer Science, 2015, 105(12).
[4] Yang C Y , Brooks E , Li Y , et al. Detection of picomolar levels of interleukin-8 in human saliva by SPR[J]. Lab on a Chip, 2005, 5(10):1017-1023.
[5] Shewell L K , Day C J , Kutasovic J R , et al. N-glycolylneuraminic acid serum biomarker levels are elevated in breast cancer patients at all stages of disease. 2021.