G蛋白偶联受体那些事儿
G蛋白偶联受体(G Protein-Coupled Receptor, GPCR)是哺乳动物基因组中最大的膜蛋白家族,广泛分布于中枢神经系统、心血管、免疫系统等器官/组织,参与了机体的各项生命活动。
GPCR调控着细胞对激素、神经递质的大多数应答:视紫质保证了视觉,β-肾上腺素受体保证了血糖水平,5-羟色胺受体掌握了人类的幸福密码。同时,GPCR也是药物研发中的关键靶点,目前已获批且靶向GPCRs的药物有475种,占所有FDA批准药物的34%,药物类型涵盖丰富,例如糖尿病、肥胖、阿尔兹海默症等疾病。
但是针对GPCR的新药研发存在着诸多挑战。首先GPCR靶点结构不稳定、表达量低,导致部分蛋白较难获取。纯化得到的蛋白也面临着极易失活、可溶性差的问题,需要添加去垢剂、脂类组分等维持GPCR的天然构象和活性。所以,找到一种既能保证GPCR活性状态,又能对其开展理化性质表征的检测技术尤为关键。Biacore分子互作系统即是采用了一种持续流检测技术,时刻保证GPCR处于溶液状态;无需对分子进行标记处理,减少对蛋白空间构象的影响;缓冲液兼容性高,支持各类去垢剂/脂类的存在。所以,Biacore非常适合于GPCR相关的机制探究、结构信息解读、药物开发等各种分子间的互作实验!
今天,就让我们一起来看看Biacore和GPCR的有趣故事吧!
01. GPCR与机械运动
2021年,华东师范大学等单位在《Journal of Biological Chemistry》发表文章《Structural basis for CD97 recognition of the decay-accelerating factor CD55 suggests mechanosensitive activation of adhesion GPCRs》。CD97属于B类G蛋白偶联受体,参与肿瘤的分化、迁移、侵袭和转移过程,文章阐述了CD97及其配体CD55(衰老加速因子)介导免疫紊乱的病理过程。该文章借助X-ray、Biacore等技术平台揭示了GPCR CD97与CD55的结合模式及动力学参数,并结合突变实验验证了CD97分子中的D63、D81、E86、V137位氨基酸残基为介导其识别CD55的关键氨基酸,实验结果也与结构学信息相符。此研究内容为GPCR CD97与CD55的粘附力感应机制提供了理论基础。
图1 野生型/突变体CD97与CD55的动力学数据[1]
02. GPCR与皮肤松弛
图2 RXFP1与relaxin的动力学表征(A图:RXF1的82-707 aa; B图:391-707aa,不含N端;)[2]
03. 针对GPCR的小分子筛选
研究人员探究了9个激动剂与腺苷A2A受体的相互作用情况,比较DDM胶束与rHDL两种状态下的腺苷A2A受体的表现差异。文章中采用NTA芯片,成功将DDM胶束或rHDL双分子层状态的腺苷A2A受体稳定的偶联在芯片表面并展开了药筛工作。
关于rHDL与小分子配体的结合信息研究,这是首次在没有放射或荧光标记示踪分子的情况下,通过SPR在rHDL重组的GPCR上实现配体亲和力和结合动力学的测量。此外,研究团队借助Biacore验证了“rHDL重组形式+含去垢剂DDM”实验方案下的pKD结果一致性,见图3,R2=0.9569。
图3 多个激动剂与不同形式的腺苷A2A受体的动力学表征与结果一致性分析[3]
04. GPCR与单域抗体
实验中,采用NTA芯片捕获了带His标签的APJ(纳米盘形式),并借助单循环(Single-cycle)检测方式,快速拿到了高质量的检测数据。Single-cycle是非常高效的检测方式,省去解离时间、无需摸索再生条件,也可以用于实验的条件优化。
图4 单域抗体激动剂与APJ的动力学表征[4]
05. GPCR与血液中Ga2+稳态
2021年,上海药物所等单位在《Elife》杂志上发表文章《Structural insights into the activation of human calcium-sensing receptor》,围绕CaSR(人钙感应受体)如何切换非活性状态、含有激动剂PAM状态展开了探究。CaSR能感受血液中细胞外Ca2+水平的微小变化,CaSR功能障碍或其基因突变会导致Ca2+稳态失调,患家族性低钙高血症、新生儿重度甲状旁腺功能亢进等病症。
研究人员借助Biacore设备筛选到多个抗体,能特异性结合非活性状态的CaSR,从而制备了抗原抗体复合物,并借助Cryo-EM解析CaSR的结构信息,为探究CaSR的感应机制提供了理论基础。实验中,直接将CaSR-ECD固定在CM5芯片上,纳米抗体作为流动相进行亲和力、动力学表征,最终筛选到NB-2D11制备对应的复合物。Biacore在得到亲和力(KD)的同时,也能计算出动力学参数(Ka/Kd),帮助我们筛选出高亲和、慢解离的互作分子。
图5 纳米抗体与非活性CaSR-ECD的动力学表征[5]
06. GPCR与心血管疾病治疗
研究人员把AT1固定在CM5芯片上,COMP(血管细胞外基质蛋白)作为流动相进行检测。值得注意的是,HBS buffer中加入0.01% (w/v) DDM与0.002% (w/v) CHS,可用于维持GPCR分子的天然活性及构象,相关实验结果见图6。
图6 血管细胞外基质蛋白(COMP)/血管紧张素(Ang II)/凝血酶敏感蛋白(TSP-1)与AT1的动力学表征[6]
07. 高通量配体筛选平台搭建
课题组借助Biacore设备完成了15个潜在配体与A2AR的识别-结合模式的进一步确证工作(单剂量实验与精确动力学表征),最终找到了高亲和识别A2AR的配体3288。实验中,研究人员使用了Biacore控温功能,检测10℃条件下配体-受体的互作情况,同时也在实验体系中添加了0.1% (w/v) LMNG与0.02% (w/v) CHS。精确的控温效果与去垢剂兼容性,既保证了GPCR的活性,也满足了多元化的实验设计。
图7 针对A2AR的结合配体筛选及动力学表征数据[7]
08. 重构脂质双分子层
经验证,此实验方案具有(1)无需纯化受体蛋白;(2)受体均匀分布、朝向统一;(3)可达到高偶联水平,用于低分子量的配体检测工作。如图8所示,首先将1D4抗体固定在L1芯片表面,参考芯片指南(3.3 mM POPC +5 mM Chapso)构建脂质双分子层,然后定向捕获CXCR4。实验人员使用了多组构象敏感型抗体与CXCR4进行配对测试,结果均说明Biacore平台可被广泛用于研究膜相关受体。
图8 重构脂质双分子层实验流程及构象敏感型抗体的测试实验[8]
1. 可提供动力学、亲和力参数:多维度解析研究内容,提供定性定量的实验数据;
2. 温控范围4-45℃(±0.003℃):满足不同温度条件下的实验条件设计;
3. 兼容去垢剂:还原GPCR的脂质双分子层环境;
4. 芯片种类丰富:例如L1芯片,可直接在芯片表面构建脂质双分子层;
5. GPCR兼容性高:多聚体、纳米盘(nanodisc)、重组高密度脂蛋白(rHDL)等,多样的实验方案可供参考;
6. 支持单循环动力学:省事省力的完成实验,无需摸索再生条件、节省解离步骤;
GPCR作为跨膜蛋白家族中的翘楚,介导着众多至关重要的信号通路。随着对GPCR结构生物学、药理学和药靶结合模式更加深入的研究,大量新药靶点的发现,GPCR药物研发将继续新的征程。Biacore作为分子互作检测的“金标准”,在探究分子机制、药靶结合表征、抗体/小分子化药筛选等方面也有着非常丰富的成功案例 。