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询价笑傲江湖，谁与争锋——2020 近千篇CNS 文章问世都离不开 TA
在过去的一年里，虽然经历了新冠疫情的磨难，但是 Biacore 与广大科研人员一起并肩战斗，砥砺前行，同样在很多领域取得了丰硕的成果，仅 2020 年度全球科研人员使用 Biacore 所发表文章的数量便已超过 13,000 篇，相当于每天都有 30 多篇使用 Biacore 的文章发表出来。而在 CNS 各类期刊的总发表量也已高达 983 篇，几乎是其他同类技术全年发表量的总和，可以说是笑傲整个互作江湖！现在小编就以 CNS 主刊上所发表的部分文章为例，向大家详细展示 Biacore 的十八般武艺！
2020 年，有近百篇在 CNS 主刊上发表的文章都使用了以 Biacore 为代表的 SPR 技术，应用方向也几乎涵盖了基础科研与药物研发的各个领域。如病毒入侵、中和抗体筛选、疫苗设计、肿瘤发生、信号传导、神经调控、细胞凋亡、核酸结构以及小分子药物筛选等。仅与新冠病毒研究相关的文章就高达 22 篇，这其中有半数都出自中国本土的研究人员。可以说 Biacore 在整个新冠病毒研究的很多领域都发挥了重要的作用。那么，这些文章里面，都使用 Biacore 解决了哪些问题呢？
图1 中和抗体发挥功能的多重机制探索（取自新冠类文献21）
- 中科院微生物所严景华/王奇慧研究员、中科院北京生命科学研究院高福院士在《Nature》上发表文章《A human neutralizing antibody targets the receptor-binding site of SARS-CoV-2》，借助 Biacore 8K 完成了两株人源中和抗体 CA1、CB6 与 SARS-CoV-2 RBD 的亲和力及动力学参数检测。
- VIB-UGent 医学生物技术中心与根特大学生物化学与微生物学系研究团队在《Cell》上发表文章《Structural Basis for Potent Neutralization of Betacoronaviruses by Single-Domain Camelid Antibodies》，借助 Biacore X100 完成了 MERS-CoV RBD、SARS-CoV RBD 与单域羊驼抗体的亲和力及动力学参数检测。
2020 年 7 月
- 北京大学谢晓亮教授、中科院医学科学研究院秦川研究员、首医附属佑安医院金荣华院长等研究团队在《Cell》上发表文章《Potent Neutralizing Antibodies against SARS-CoV-2 Identified by High-Throughput Single-Cell Sequencing of Convalescent Patients’ B Cells》，借助 Biacore T200 完成了 Viral protein binding（病毒蛋白结合实验），从 60 个新冠恢复期病人血清中筛选到 14 个能与 SARS-CoV-2 的 Spike 或 RBD 具有高亲和力的中和单抗。
2020 年 8 月
- 科隆大学 Florian Klein 教授研究团队在《Cell》上发表文章《Longitudinal Isolation of Potent Near-Germline SARS-CoV-2-Neutralizing Antibodies from COVID-19 Patients》，借助 Biacore T200 完成了 25 个中和抗体与 RBD 的亲和力及动力学参数检测。
2020 年 11 月
- 华盛顿大学 David Veesler 研究团队在《Science》上发表文章《Ultrapotent human antibodies protect against SARS-CoV-2 challenge via multiple mechanisms》，借助 Biacore T200 完成了中和抗体 S2E12、S2M11 与 RBD 的亲和力及动力学参数检测。
图2 γδ T细胞检测癌症发生及感染机制探索（取自非新冠类文献21）
- 美国 AbbVie 公司研发团队发现了一种高效的选择性抑制剂 ABBV-744，其能选择性抑制 BET 家族蛋白的 BD2 结构域功能，并在《Nature》上发表文章《Selective inhibition of the BD2 bromodomain of BET proteins in prostate cancer》。在该研究中，研究人员借助 Biacore T200 完成了小分子 ABBV-075/ABBV-744 与 BD1/BD2 的多组亲和力及动力学参数检测。
- 澳大利亚墨尔本大学和奥利维亚牛顿-约翰癌症研究所等研究团队在《Science》上发表文章《Butyrophilin 2A1 is essential for phosphoantigen reactivity by γδ T cells》，揭示了 γδ T 细胞检测癌症和感染新机制。在该研究方案中，研究人员借助 Biacore T200 完成了 BTN2A1 与 Vγ9+Vδ2+、Vγ9+Vδ1+与 Vγ5+Vδ1+ γδTCRs 的多组亲和力检测。
2020 年 3 月
- 澳大利亚 Peter MacCallum 癌症中心 Mark A. Dawson 和英国葛兰素史克药物研究中心 Rab K. Prinjha 研究团队发现癌症和免疫炎症中，BET 蛋白的 BD1 和 BD2 可作为选择性靶点，并在《Science》上发表文章《Selective targeting of BD1 and BD2 of the BET proteins in cancer and immuno-inflammation》。在该项研究中，研究人员借助 Biacore S200 完成了化合物 I-BET151、iBET-BD1、iBET-BD2 与蛋白 BRD4-BD1、BRD4-BD2 的多组亲和力及动力学检测。
2020 年 4 月
- 密歇根大学研究团队发现小分子 DT-061 可以特异性地稳定 B56α-PP2A 全酶，从而使其去磷酸化以达到抑癌效果，并在《Cell》上发表文章《Selective PP2A Enhancement through Biased Heterotrimer Stabilization》。在该项研究中，研究人员借助 Biacore T200 完成了 B56α、B56γ 与 AC dimer (±DT-061) 的多组亲和力及动力学检测，并证实 DT-061 能直接稳定 AB56αC 异源三聚体的空间构象。
2020 年 7 月
- 斯坦福大学医学院 K. Christopher Garcia 研究团队发现磷酸酶募集抑制受体（RIPR）可增强 T 细胞活性，并显著减缓小细胞肺癌和结肠腺癌进展，并在《Nature》上发表文章《Immune receptor inhibition through enforced phosphatase recruitment》。在该项研究中，研究人员借助 Biacore T100 完成了 RIPR-PD1 与 CD45、PD1 的多组亲和力及动力学检测。
2020 年 8 月
- 美国默克公司 George H. Addona、David Jonathan Bennett 研究团队发现了具有抗肿瘤活性的口服可用的非核苷酸 STING（干扰素基因的刺激物）激动剂，并在《Science》上发表文章《An orally available non-nucleotide STING agonist with antitumor activity》。在该项研究中，研究人员借助 Biacore T200 完成了激动剂 MSA-2 与 hSTING-WT、mouse STING 的多组亲和力及动力学检测。
图3 SARS-CoV-2入侵机制研究（取自新冠类文献1）
- 明尼苏达大学兽医与生物医学系 Ashley Auerbach1 、Fang Li 研究团队在《Nature》上发表文章《Structural basis of receptor recognition by SARS-CoV-2》，借助 Biacore 3000 完成了 RBDs 与 hACE2 的亲和力及动力学参数检测。
2020 年 5 月
- 中科院微生物所严景华研究员所在团队在《Cell》上发表文章《Structural and Functional Basis of SARS-CoV-2 Entry by Using Human ACE2》，借助 Biacore 8K 证实了 SARS-CoV-2-S1、SARS-CoV-2-CTD 与 hACE2 存在特殊相互作用。
2020 年 8 月
- 中科院北京生命科学研究院高福院士、中科院微生物所严景华研究员、中国医学科学院秦川研究员等研究团队在《Cell》上发表文章《A Universal Design of Betacoronavirus Vaccines against COVID-19, MERS, and SARS》，借助 Biacore 3000 完成了多组 RBD-sc-dimer、RBD-monomer 与 hACE2 的亲和力及动力学参数检测。
2020 年 10 月
- 麻省大学医学院 Jeremy Luban 研究团队在《Cell》上发表文章《Structural and Functional Analysis of the D614 G SARS-CoV-2 Spike Protein Variant》，借助 Biacore T200 完成了 SARS-CoV-2 WT/D614 G S Protein 与 ACE2 的亲和力及动力学参数检测。
2020 年 11 月
- 布里斯托大学生物化学学院 Imre Berger、 Christiane Schaffitzel 研究团队在《Science》上发表文章《Free fatty acid binding pocket in the locked structure of SARS-CoV-2 spike protein》，借助 Biacore T200 完成了 LA-bound S trimer、apo S trimer 与 ACE2 的亲和力及动力学参数检测。
图4 人免疫球蛋白超家族相互作用的复杂网络相关研究（取自非新冠类文献5）
- 耶鲁大学医学院免疫生物学系 Aaron M. Ring 研究团队在《Nature》上发表文章《IL-18BP is a secreted immune checkpoint and barrier to IL-18 immunotherapy》，借助 Biacore T100 完成了 IL-18BP、IL-18Rα 与 IL-18 的亲和力及动力学参数检测。
2020 年 7 月
- 南旧金山基因泰克微化学蛋白质组学和脂质组学系 Nadia Martinez-Martin 研究团队揭示了免疫球蛋白超家族与癌症发生的相关信号通路，并在《Cell》上发表文章《The Immunoglobulin Superfamily Receptome Defines Cancer-Relevant Networks Associated with Clinical Outcome》。在该研究中，研究人员借助 Biacore 8K 完成了 PD1-Fc、PDL1-Fc、PDL2-Fc 与 EPHA3、CEACAM4、LILRA3 等分子间的多组亲和力及动力学参数检测。
2020 年 8 月
- 美国斯坦福大学医学院 K. Christopher Garcia 和 Woj M. Wojtowicz 研究团队利用人 IgSF 细胞表面相互作用揭示了蛋白质-蛋白质相互作用（PPI）的复杂网络，并在《Cell》上发表文章《A Human IgSF Cell-Surface Interactome Reveals a Complex Network of Protein-Protein Interactions》。在该研究中，研究人员使用 Biacore T200 检测了 WFIKKN2-Fc、ICAM5-Fc、IGFBPL1-Fc 等与 DCC-Fc、PUNC-Fc、PUNC e11-Fc 等分子的相互作用并展开相应的筛选工作。
中国四川大学、澳门科技大学和北京协和医学院等研究机构构建出由 S 蛋白的受体结合结构域（RBD）氨基酸残基 319-545 组成的重组疫苗（S-RBD 疫苗），随后发现在小鼠、兔子和非人灵长类动物恒河猴体内进行这种重组疫苗单剂注射后 7 或 14 天内就诱导出有效的功能性抗体反应，并在《Nature》上发表文章《A vaccine targeting the RBD of the S protein of SARS-CoV-2 induces protective immunity》。在该研究中，研究人员借助 Biacore 8K 完成了 RBD 与 ACE2 的亲和力及动力学参数检测。
2020 年 8 月
高福院士、严景华、秦川、戴连攀等研究员针对包括中东呼吸综合征（MERS）、2019 冠状病毒病（COVID-19）以及重症急性呼吸综合征（SARS）在内的 β 冠状病毒感染性疾病开发出了通用的疫苗策略，并在《Cell》上发表文章《A Universal Design of Betacoronavirus Vaccines against COVID-19, MERS, and SARS》。在该研究中，研究人员借助 Biacore 3000 完成了 MERS-CoV-RBD-sc-dimer、RBD-monomer 与 hCD26 蛋白的亲和力及动力学参数检测。
图5 重塑神经突触相关研究（取自非新冠类文献20）
- 马克斯·普朗克神经生物学研究所、牛津大学生物化学系的 Ru diger Klein、Elena Seiradake 研究团队在《Cell》上发表文章《Structural Basis of Teneurin-Latrophilin Interaction in Repulsive Guidance of Migrating Neurons》，借助 Biacore T200 完成了 WT/Mutant murine Lphn 1（乳蛋白 1）与 Ten2（肌腱蛋白 2）的多组亲和力及动力学参数检测。
2020 年 8 月
- 日本庆应义塾大学医学院 Michisuke Yuzaki 研究团队《Science》上发表文章《A synthetic synaptic organizer protein restores glutamatergic neuronal circuits》，设计并表征了一种结合了小脑肽 1 和神经元穿透素 1 结构元件的合成突触组织因子（CPTX）。CPTX 可以与突触前神经毒素和突触后 AMPA 型离子型谷氨酸受体相互作用，并在体内和体外诱导兴奋性突触的形成。在此项研究中，研究人员借助 Biacore T200 完成了 CPTX/NP1PTX/Cbln1 与 GluD2/GluA1–4 的多组亲和力及动力学检测。
- 中科院生物物理所王大成/丁璟珒研究员与北京生命科学所邵峰研究员所在研究团队在《Cell》发表文章《Structural Mechanism for GSDMD Targeting by Autoprocessed Caspases in Pyroptosis》，借助 Biacore 8K 完成了 CASP4/CASP11 与 GSDMD-C 的多组亲和力及动力学参数检测。
2020 年 7 月
- 上海有机所许代超与哈弗医学院研究团队在《Nature》上发表文章《Modulating TRADD to restore cellular homeostasis and inhibit apoptosis》，借助 Biacore T200 完成了 Apt-1 与 TRADD-N 的亲和力及动力学参数检测，揭示了 Apostatin-1 小分子靶向 TRADD 蛋白调控细胞死亡以及激活自噬恢复细胞稳态的分子机制。
- 哈佛医学院生物化学与分子药理学系 Haribabu Arthanari、Christoph Gorgulla 研究团队在《Nature》上发表文章《An open-source drug discovery platform enables ultra-large virtual screens》，借助 Biacore T200 完成了药物高通量筛选平台的搭建工作。
2020 年 4 月
- 凯斯西储大学医学院药理学系 Derek J. Taylor 与密歇根大学内科医学系遗传医学系 Goutham Narla 研究团队在《Cell》上发表文章《Selective PP2A Enhancement through Biased Heterotrimer Stabilization》，证实了小分子 DT-061 可以特异性地稳定 B56α-PP2A 全酶，从而使其去磷酸化以达到抑癌效果。
瑞士苏黎世大学 Markus A. Seeger 研究团队在《Nature》上发表文章《The ABC exporter IrtAB imports and reduces mycobacterial siderophores》，借助 Biacore 3000 完成了 Fe-cMBT 与 WT SID 、mutant SID (3×E mutant) 的多组亲和力检测，并得出结论：IrtAB（ATP 结合盒（ABC））介导分枝杆菌铁载体的转入和还原。
2020 年 11 月
美国威斯达研究所 Farokh Dotiwala 研究团队在《Nature》上发表文章《IspH inhibitors kill Gram-negative bacteria and mobilize immune clearance》，借助 Biacore T200 完成了 HMBPP/C23.21/C23.20 与 IspH 的多组亲和力检测，并得出结论：新型 IspH 抑制剂分子可杀死一系列革兰氏阴性细菌，并快速激活宿主产生免疫反应。
宾夕法尼亚大学生物化学与生物物理系 Ben E. Black 与魁北克蒙特利尔大学蒙特利尔医学院 John M. Pascal 研究团队在《Science》上发表文章《Structural basis for allosteric PARP-1 retention on DNA breaks》，借助 Biacore 3000 证实了 PARP-1 在抑制剂存在条件下能与 DNA 发生相互作用，并得出结论：聚（ADP-核糖）聚合酶-1（PARP-1）抑制剂（PARPi）能否成功治疗癌症，与它们在 DNA 断裂位点抑制 PARP-1 的能力有关。
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