Biacore高效筛选开启胰腺癌治疗新思路

Biacore高效筛选开启胰腺癌治疗新思路

Biacore高效筛选开启胰腺癌治疗新思路

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药物筛选是新药研发中的一个重要关口,Biacore凭借高灵敏度、低噪音值、支持有机溶剂矫正等优势,确保了药物筛选中的数据质量和分辨率;而其对高通量微孔板的兼容、对样品仓精准控温的设计、可以实现无人值守检测,又保证了药物筛选中的实验效率。
2025年南开大学药学院在《Journal of Hematology & Oncology》期刊发表研究论文,深入探讨了胰腺癌发病机制,并且开展了天然产物的筛选工作。

研究揭示了Sorcin蛋白在胰腺癌中作为铁死亡抑制因子的作用机制:Sorcin通过与PAX5相互作用阻止其核转位,降低FBXL12表达,减少ALDH1A1泛素化,从而抑制铁死亡。在聚焦到Sorcin蛋白之后,研究人员在Biacore上对天然产物文库进行了筛选,期望快速找到与Sorcin蛋白结合的潜在药物。

实验中将Sorcin蛋白氨基偶联于传感芯片,Biacore预设的筛选程序自动完成304个天然产物的单浓度进样,得到每个药物与靶点蛋白的结合响应值(RU),经过分析软件的分子量校准之后,成功鉴定出雷公藤红素(Celastrol)能够与Sorcin蛋白发生特异性结合(图1)。

Biacore筛选出与Sorcin蛋白结合的药物雷公藤红素
图1:Biacore筛选出与Sorcin蛋白结合的药物雷公藤红素
Celastrol与Sorcin蛋白的亲和力实验显示该药物与靶点蛋白的亲和力达到了2.13 µM(图2),后续的细胞和动物实验也确证了该药物的作用机制:雷公藤红素通过结合Sorcin蛋白,阻断其与PAX5的互作,使PAX5进入细胞核并激活FBXL12表达,而表达的FBXL12促进ALDH1A1的泛素化降解,导致脂质过氧化物积累,最终触发铁死亡。
Biacore检测Celastrol与Sorcin的亲和力
图2:Biacore检测Celastrol与Sorcin的亲和力
对于片段药物/小分子化合物筛选,Biacore已经有成熟的实验方案,预设的实验程序以及自动化的数据分析模型,完整的“Clean screen – Binding level screen – Affinity screen”三步法高效完成药物筛选流程。
1. Clean sceen剔除“粘性”化合物,避免残留影响后续实验
如下图中Sensorgram A呈现典型的“快上快下”形态,表示该片段没有残留结合;Sensorgram B进样结束后,信号没有完全回到基线,出现明显的残留响应,可能是“sticky”化合物。Sensorgram C进样期间信号异常,且结束后仍保持较高水平,几乎没有解离。说明该片段结合非常强或形成聚集,残留结合严重。
Biacre的Clean screen实验方案结果
图3:Clean screen结果
2. Binding Level Screen:根据结合水平和曲线形态筛选潜在片段
Binding Level Screen的结果通常以Plot图的形式呈现,如下图中横坐标是筛选的样品,纵轴选择了binding_early报告点的结合响应值(经过自动分子量校准),并且在Plot图中用不同颜色标识出不同的结合行为类型,包括None(正常结合),Slope(进样时信号持续上升,说明结合速度慢或有聚集),Slow diss(进样结束后信号未能迅速回到基线,表明解离缓慢),R>Rmax(响应值超过理论最大值,可能由于非特异性结合或聚集)。
Biacore的Binding level screen结果
图4:Binding level screen结果
3. Affinity Screen:进一步验证结合并估算亲和力
该阶段确认在前两步(Clean Screen和Binding Level Screen)中筛选出的片段是否真正与靶标结合,并且通过模型拟合出亲和力数值。
超越单靶点!Biacore验证TMEM175双位点协同,开启神经退行治疗新范式

超越单靶点!Biacore验证TMEM175双位点协同,开启神经退行治疗新范式

超越单靶点!Biacore验证TMEM175双位点协同,开启神经退行治疗新范式

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帕金森病(PD)作为第二大神经退行性疾病,全球患者超600万,其病理核心α-突触核蛋白异常沉积的清除机制一直是研究难点。

跨膜蛋白175(TMEM175)的上调通过促进α-突触核蛋白聚集体的清除,具有改善帕金森病(PD)的潜力。理解TMEM175激动剂的结构基础对于揭示其PD治疗潜力至关重要。

近日,中山药物创新研究院、中国科学院上海药物研究所、南京中医药大学药学院及中南大学湘雅医院等13家单位联合在《Neuron》发表最新研究,首次解析人源TMEM175离子通道与三种激动剂的冷冻电镜结构,为基于结构的药物设计奠定了基础,并验证了TMEM175激动剂可有效降低病理性α-synuclein水平,为开发治疗PD的新型DMT提供了重要思路。

图1:文章截图
研究团队通过Biacore表面等离子共振(SPR)技术、系统性诱变、全内体溶酶体膜片钳技术及分子动力学模拟展开综合研究,研究结果一致表明DCY1020/1040结合在两个亚基的界面,诱导开放构象,而协同激动剂TUG-891进一步增强了这一构象,这些激动剂能促进病理性α-突触核蛋白的清除。

在帕金森病靶点TMEM175激动剂的研发中,精确测定小分子与靶蛋白的结合亲和力是优化先导化合物的关键一步。研究团队如何运用Biacore 8K系统,为DCY1020、DCY1040等候选分子提供关键的动力学数据支撑?

研究人员使用Biacore 8K SPR系统,对候选分子与TMEM175的结合进行了精准量化:

  • 芯片固定化:氨基偶联法,将经过peptidisc稳定化处理的TMEM175蛋白共价固定于CM5传感器芯片上,确保了靶蛋白在天然状态下的活性。
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    样品检测:将候选化合物DCY1020、DCY1040和TUG-891进行梯度稀释,以30 μL/min的流速进样,实时监测分子结合与解离过程。
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    数据分析:通过Biacore Insight专业软件进行动力学分析,获得结合亲和力(KD值)等关键参数,为结构优化提供明确方向。
Biacore数据清晰地证实了三种激动剂与TMEM175的特异性结合,且均未与空白peptidisc结合。这一发现为后续的冷冻电镜结构解析提供了关键的动力学数据支撑。正是基于这些精准的参数,研究团队成功揭示了TMEM175独特的“双位点协同激活”机制:DCY1020/1040结合于亚基界面诱导开放,而TUG-891在另一远离位点进一步稳定该构象。

图2:DCY1020与人类TMEM175结合

DCY1020未显示与peptidisc的结合

图3:DCY1040与人类TMEM175结合

DCY1040未显示与peptidisc的结合

图4:TUG-891与人类TMEM175结合

TUG-891未显示与peptidisc的结合

正是基于这些精准的结合参数,研究团队得以成功捕获TMEM175在激动剂作用下的开放构象,从而在原子层面直观揭示了其独特的“双位点协同激活”机制。

由此可见,此项研究成功地将精准的动力学数据(Biacore)、清晰的原子结构(Cryo-EM)与可靠的功能验证相结合,完整地诠释了TMEM175的激活机制。这不仅为帕金森病的药物开发指明了新方向,也再次证明,多技术平台的紧密协同,是攻克复杂靶点、推动源头创新的有效路径。

从TMEM175双位点协同机制的突破性解析,到帕金森病疾病修饰治疗新路径的开辟,Biacore始终以“分子互作金标准”的硬核实力,为科研创新注入关键动能。从靶点验证初筛阶段锚定有效方向,到候选分子优化时实现精准迭代,再到生产质控环节保障产品稳定性,每一步都以可靠数据筑牢创新根基。

无论是破解病理谜题,还是推动药物的临床转化,Biacore都如科研路上的“精准导航仪”,助力科学家突破技术瓶颈。以技术创新赋能基础研究,以全流程支撑加速药物落地,最终让更多像帕金森病这样的难治性疾病患者看到希望,持续为生命科学进步与人类健康保驾护航。

胃癌靶向治疗新思路, Biacore觅得赫赛汀有效增敏剂

胃癌靶向治疗新思路, Biacore觅得赫赛汀有效增敏剂

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胃癌是我国最常见的消化系统恶性肿瘤之一,患病率高,进展较快,严重影响人民健康。目前,由于胃癌的肿瘤异质性和化疗药物的耐药等问题,进展期胃癌综合治疗效果欠佳,因而开发新型胃癌治疗药物意义重大。

曲妥珠单抗(trastuzumab)通过与HER2受体的细胞外区域结合, 抑制HER2同源二聚,从而阻止HER2 介导的信号转导,并且促进抗体依赖的细胞毒性作用,导致表达HER2 的细胞死亡,在胃癌中显示出生存获益。但是,许多接受曲妥珠单抗治疗的HER2阳性胃癌患者由于细胞敏感性不足和耐药性导致患者的用药反应差,对于临床治疗仍然具有巨大的挑战

新冠病毒跨种传播机制研究

2021兰州大学第二医院萃英生物医学研究中心焦作义团队Nature Communications发表题为“Hyperactivation of HER2-SHCBP1-PLK1 axis promotes tumor cell mitosis and impairs trastuzumab sensitivity to gastric cancer”的研究论文,报道了HER2下游存在的一条新的信号通路HER2/Shc1/SHCBP1/PLK1,该信号通路的异常激活与曲妥珠单抗耐药密切相关。并据此筛选发现了新型的SHCBP1-PLK1复合体的抑制剂茶黄素-3, 3’-双没食子酸(TFBG),可显著增敏曲妥珠单抗治疗胃癌的疗效

如图1所示,HER2和其他表皮生长因子受体(ERBBs)始终使用Shc1(一种细胞内支架蛋白)募集细胞质靶标激活下游途径,包括促分裂原活化蛋白激酶(MAPK)和磷脂酰肌醇3-激酶(PI3K)途径,并通过增加细胞增殖,转移和侵袭来促进肿瘤发生。SHCBP1是一种Shc1结合蛋白,在HER2激活后与支架蛋白Shc1脱离。释放的SHCBP1在Ser273磷酸化后进入细胞核,从而对HER2级联反应,然后通过与PLK1结合促进有丝分裂相互作用因子MISP的磷酸化来调控细胞有丝分裂。同时,Shc1被募集到HER2进行MAPK或PI3K途径激活。HER2-SHCBP1-PLK1这一关键的信号通路驱动曲妥珠单抗敏感并在治疗上具有针对性。

图1 胃癌治疗靶点HER2下游新的信号通路HER2/Shc1/SHCBP1/PLK1
图1 胃癌治疗靶点HER2下游新的信号通路HER2/Shc1/SHCBP1/PLK1

据此研究人员采用虚拟筛选和SPR的方法,寻找抑制SHCBP1–PLK1结合的天然产物。在用Biacore进行小分子筛选时,将PLK1偶联到CM5芯片上,40个小分子化合物以100uM的浓度进样,经过分子量校正后通过与阳参的对比可以得到候选的小分子抑制剂(图2)。

图2 Biacore对40个小分子化合物进行亲和力筛选
图2 Biacore对40个小分子化合物进行亲和力筛选

最终研究人员选择了亲和力最强的小分子TFBG,与PLK1的亲和力为4.67 ×10-7M(图3)。TFBG对SHCBP1–PLK1互作的抑制也通过后续的Co-IP和细胞FERT实验得到了验证。在动物实验中,TFBG治疗与曲妥珠单抗联合显示出显著的生长抑制和肿瘤消退,表明在HER2阳性胃癌治疗中的潜在临床应用。

图3 Biacore检测TFBG与PLK1的亲和力
图3 Biacore检测TFBG与PLK1的亲和力

回顾整篇文章,研究人员采用LC-MS/MS、免疫组化、FERT、原位杂交等多种方法明确了HER2下游新的信号通路HER2/Shc1/SHCBP1/PLK1,然后以抑制SHCBP1–PLK1互作为目标,找到了小分子抑制剂TFBG,最后在细胞实验和动物实验中,TFBG联合曲妥珠单抗的方案都显示了显著的抗肿瘤效果,为胃癌临床靶向治疗提供了新思路,也对天然药物研发产生了有力推动作用。

图4 文章整体思路
图4 文章整体思路

高灵敏度的Biacore在小分子抑制剂的筛选和表征中可以输出可靠的数据,无人值守的操作能够满足高通量筛选的需求,兼具了数据质量和筛选效率。智能的筛选分析模块可以自动对样品进行分子量校正,方便直接用响应值的高低进行比较,并且可以根据需求自动进行排序或者划分阈值线,直观地呈现筛选结果,极大地提高实验效率,保证在药物开发过程中的高效性。

参考文献:

Shi, Wengui et al. “Hyperactivation of HER2-SHCBP1-PLK1 axis promotes tumor cell mitosis and impairs trastuzumab sensitivity to gastric cancer.” Nature communications vol. 12,1 2812. 14 May. 2021, doi:10.1038/s41467-021-23053-8

Biacore技术“拆解”MCL-1/BAK:靶向抗癌药物设计新突破!

Biacore技术“拆解”MCL-1/BAK:靶向抗癌药物设计新突破!

Biacore技术“拆解”MCL-1/BAK:靶向抗癌药物设计新突破!

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线粒体凋亡途径的调控是肿瘤发生与治疗的核心机制之一。抗凋亡与促凋亡BCL-2家族蛋白间的精密互作与动态平衡调控着线粒体外膜通透性(MOMP),并最终决定细胞命运。

其中,抗凋亡蛋白MCL-1通过结合并抑制促凋亡蛋白BAK的寡聚化,成为肿瘤细胞逃逸凋亡的关键分子。然而,MCL-1与BAK相互作用的分子细节尚不完全明确,限制了靶向该通路的高效抗癌药物开发。

中南大学湘雅医院肿瘤科及暨南大学的研究人员在《Acta Neuropathologica Communications》中发表文章,利用Biacore技术,系统解析了MCL-1与BAK结合的分子特异性,揭示了p5疏水亚口袋在相互作用中的核心作用,为设计新型MCL-1抑制剂提供了关键理论依据。

Biacore 8K助力靶向渐冻症TDP-43免疫疗法
图1:文章截图
为了揭开MCL-1/BAK相互作用的神秘面纱,研究团队整合了表面等离子共振(SPR)、荧光偏振(FP)、X射线晶体学及细胞实验技术,构建了从分子识别到功能验证的完整研究链条。

通过X射线晶体学解析复合物结构(分辨率1.98 Å),发现BAK多肽呈现α螺旋构象,其疏水残基Val74、Leu78、Ile81和Ile85精准嵌入MCL-1的BH3结合沟槽(图2A、B),带电荷残基Asp83 BAK与Arg263 MCL-1之间形成了保守的盐桥相互作用(图2C)。与BAK-BH3short多肽相比,BAK-BH3long多肽的延伸残基额外形成一个α螺旋转角(α-helical turn),且h4残基(Ile85)位置发生微小位移(图2A)。

在延伸的五个残基中,Arg88 BAK、Asp90 BAK、Ser91BAK和Glu92 BAK与MCL-1之间基本不存在范德华相互作用(图2D)。然而,Tyr89 BAK与MCL-1的疏水平面区域(由Val216、Phe318和Phe319等疏水残基构成)形成显著的疏水相互作用(图2D)。

综上,MCL-1通过p5亚口袋特异性识别BAK C端延伸序列(尤其Tyr89),相比之下,BCL-XL则依赖经典BH3沟槽结合,对C端序列无偏好,这也为设计靶向MCL-1/BAK的高选择性抑制剂提供理论依据。

MCL-1与BAK-BH3short和BAK-BH3long多肽的复合物晶体结构
图2:MCL-1与BAK-BH3short和BAK-BH3long多肽的复合物晶体结构
为探究MCL-1的p5疏水亚口袋功能,研究人员构建了MCL-1 F319 A突变体,利用SPR技术实时监测两者结合的动力学过程。结果显示,BAK-BH3长肽与MCL-1野生型以及MCL-1突变型的结合亲和力比短肽高约10倍(KD=33.4 nM vs.277 nM),而BAK Tyr89突变型与MCL-1野生型的亲和力为537 nM,说明MCL-1 Phe319或BAK Tyr89的突变会显著破坏二者相互作用,从而抑制凋亡进程。
使用Biacore实现MCL-1 野生型、MCL-1突变型与BAK-BH3long的动力学检测
图3:MCL-1 野生型、MCL-1突变型与BAK-BH3long的动力学检测

科学发现最终需回归细胞验证

研究团队在HEK-293 T细胞中过表达MCL-1野生型或F319 A突变体(破坏p5亚口袋),通过免疫共沉淀实验发现,突变体与BAK的结合能力下降。进一步在肝癌细胞Hep3 B中过表达BAK野生型或Y89A突变体,发现后者诱导凋亡的能力下降,证实p5亚口袋对BAK功能的重要性。

这一发现颠覆了传统认知——MCL-1不仅依赖保守的p2-p4亚口袋,还通过独特的p5亚口袋实现BAK特异性识别。基于这一发现,研究人员测试了p5亚口袋对A-1210477及其先导化合物28的潜在作用(A-1210477是首个具有高亲和力和选择性的MCL-1选择性BH3模拟物)。

结果发现,A-1210477对MCL-1的亲和力约为其先导化合物28的5倍,而MCL-1突变体F319 A对A-1210477的亲和力降低约一个数量级,而其对短链先导化合物28的结合几乎未受影响。结合竞争荧光偏振(FP)实验和共晶实验结果,研究人员得出了这个结论:A-1210477的延伸磺酰胺基团与MCL-1 p5亚口袋的紧密结合可显著提升抑制剂活性。这一发现为设计靶向p5亚口袋的高效MCL-1抑制剂提供了新策略。

A-1210477及其先导化合物28与MCL-1野生型及突变型的结合动力学
图4:A-1210477及其先导化合物28与MCL-1野生型及突变型的结合动力学
从分子层面的结构解析到细胞层面的功能验证,本研究首次揭示了MCL-1/BAK相互作用的分子密码,阐明了p5疏水亚口袋在结合中的核心作用。这一发现不仅让我们深化了对线粒体凋亡调控机制的理解,更为开发下一代MCL-1靶向抗癌药物奠定了坚实基础。

目前,癌症治疗已进入“精准时代”,而靶向MCL-1/BAK相互作用正是这一时代的典型代表之一。随着结构生物学与药物设计的不断进步,我们有理由相信,针对这一“生死开关”的精准治疗将早日造福患者,为癌症治疗带来新突破。

Biacore,for a better life

Biacore分子互作检测作为被中美日等多国药典收录的分子互作检测“金标准”,已广泛应用到基础科研与药物开发的多个领域。截至目前,借助Biacore累计发表的文章已突破68000篇,超过100种的已上市药物的研发、申报、生产过程中也均有Biacore的身影。

期待这一突破性发现能够推动肿瘤等重大疾病的精准治疗发展,通过持续深化对凋亡通路的理解,加速靶向药物的临床转化,最终为患者带来更安全有效的治疗选择。

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Biacore赋能“破冰行动”:带来靶向渐冻症TDP-43新希望

Biacore赋能“破冰行动”:带来靶向渐冻症TDP-43新希望

Biacore赋能“破冰行动”:带来靶向渐冻症TDP-43新希望

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肌萎缩侧索硬化症(Amyotrophic Lateral Sclerosis, ALS),也称为“渐冻症”,是一种进行性、致死性的神经退行性疾病,以运动神经元选择性丧失为特征,一般会导致肌肉萎缩、呼吸衰竭,患者中位生存期仅3-5年。

尽管约10%的ALS病例与明确基因突变相关(如SOD1、C9orf72),但超过97%的散发性及家族性ALS患者均存在病理性反式激活应答DNA结合蛋白(TDP-43)的异常。

此类病理改变不仅存在于ALS,也广泛见于额颞叶变(FTLD-TDP)等TDP-43蛋白病,共同构成“TDP-43蛋白病谱系”。

鉴于TDP-43病理与疾病进展的时空传播呈强相关性,且其异常聚集早于临床症状出现,靶向TDP-43的病理级联反应已成为突破当前治疗困境的核心策略。

瑞士生物制药公司AC Immune SA在《Acta Neuropathologica Communications》中发表文章,该研究首次证实:靶向TDP-43蛋白酶抗性淀粉样核心的免疫疗法,可通过阻断病理传播显著延缓或终止疾病进展。

图1:文章截图
多项早期研究表明,TDP-43的羧基末端(C端)结构域在模板化聚集中起到关键作用,因此本文报道了靶向TDP-43C端蛋白酶抗性淀粉样核心的单抗ACI-6677的开发工作。
图2:Biacore Single-Cycle检测结果
图3:ACI-6677的表位分析
作者用Biacore 8K,将TDP-43固定在CM5芯片表面,1.2-100 nM的ACI-6677作为分析物流过芯片表面,实验表明两个分子之间的亲和力高达380 pM。

后续又通过ELISA表位分析结果表明:TDP-43蛋白与单抗ACI-6677的结合表位为274-320区域。

通过构建靶向TDP-43致病性蛋白酶抗性淀粉样核心的单克隆抗体ACI-6677,该抗体对TDP-43具有pM级结合亲和力,且可结合所有C端TDP-43片段。

图4:ACI-6677可减少经FTLD-TDP脑提取物单侧接种的

CamKIIa-hTDP-43NLSm转基因小鼠中TDP-43病理的扩散

之后,文章又首次在疾病动物模型中证明,该抗体可中和具有播种能力的TDP-43,从而减少TDP-43神经病理的扩散。

动物实验结果证实了通过被动免疫疗法靶向细胞外致病性 TDP-43的重要性。这些发现也解释了其他已报道的结合TDP-43淀粉样蛋白核心区域或其远端的免疫疗法的有效性。

针对TDP-43淀粉样蛋白核心的单克隆抗体的成功制备,不仅为深入研究TDP-43C末端片段的病理生物学机制开辟了新途径,也为疾病分层提供了新的标准。

从发现TDP-43在中枢神经系统的扩散机制,到抗体中和其病理活性的突破,再到表位定位带来的精准治疗方向,这些研究成果为ALS等神经退行性疾病的治疗点亮了新的曙光。

未来,随着研究不断深入,基于开发的药物有望实现从延缓疾病进展到逆转病理损伤的跨越,为饱受ALS折磨的患者及其家庭带来治愈的希望。

我们期待科研成果加速转化,让创新疗法早日惠及每一位患者,共同见证神经退行性疾病治疗领域的全新变革!

Biacore

for your better life!

Biacore作为被中美日等多国药典收录的分子互作检测“金标准”,已广泛应用到基础科研与药物开发的多个领域。

截至目前,借助Biacore累计发表的文章已突破68000篇,超过100种的已上市药物的研发、申报、生产过程中也均有Biacore的身影。

我们同样期待越来越多神经退行性相关疾病的治病机制被发现、药物被开发,造福临床,造福人类。

Biacore点亮骨质疏松症治愈之路,让骨头重获“青春”

Biacore点亮骨质疏松症治愈之路,让骨头重获“青春”

Biacore点亮骨质疏松症治愈之路,让骨头重获“青春”

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骨质疏松症:

是一种全身性的骨骼老化或废用退化相关的代谢障碍性疾病,以骨量减少、结构退化、脆性增加,易发生骨折为特征。骨质疏松症并发症致残率高,严重影响患者的生活质量,给社会和家庭带来沉重负担,我国将其列为国家重点攻关的三大老年疾病之一。随着年龄的增长,骨代谢和体内平衡转向有利于过度激活的破骨细胞,从而导致骨质流失,这是骨质疏松症等疾病的标志。

由于破骨细胞的功能缺陷,Src基因缺失会导致严重的骨硬化,表明Src在破骨细胞中是必不可少的。因此,抑制Src激酶活性被认为是破骨细胞过度激活介导的骨质流失的有效治疗策略。G蛋白偶联受体 (GPCRs) 是约35%的获批药物的靶点,但目前尚不清楚GPCRs如何调节Src激酶活性,也不清楚这个GPCR是否可以作为治疗破骨细胞相关骨质流失的有效治疗靶点。
Src激酶去磷酸化抑制骨吸收并预防骨质流失
2024年2月12日,上海理工大学、海军军医大学上海长征医院、华东师范大学等科研单位合作在Nature子刊Nature Communications上发表了题为“Kisspeptin-10 Binding to Gpr54 in Osteoclasts Prevents Bone Loss by Activating Dusp18-mediated Dephosphorylation of Src”的研究论文,发现GPR54被其天然配体Kisspeptin-10 (Kp-10) 激活导致Dusp18去磷酸化Src激酶(图1)。Kiss1、Gpr54和Dusp18敲除小鼠均表现出破骨细胞过度激活和骨质流失,Kp-10通过抑制体内破骨细胞活性来消除骨质流失。因此,Kp-10/Gpr54是一个很有前途的治疗靶点,可以通过Dusp18介导Src激酶的去磷酸化来消除骨吸收。Biacore为GPR54与Src激酶相互作用以及GPR54与与Dusp18磷酸酶相互作用提供了关键数据。
图1:上海理工大学等发表在Nature Communications上的科学研究成果及其工作模型

图1:上海理工大学等发表在Nature Communications上的科学研究成果及其工作模型

首先,科研人员通过对基因敲除的遗传材料的分析,发现Kp-10/Gpr54主要通过抑制Src激酶的磷酸化水平来控制破骨细胞的形成和骨吸收。通过Biacore发现,GPR54的C端直接与Src激酶直接结合,亲和力KD高达2.595 nM(图2)。结果表明,Kp-10配体激活后的GPR54通过其C端招募Src激酶。
图2:Biacore检测GPR54与Src激酶结合的亲和力/动力学

图2:Biacore检测GPR54与Src激酶结合的亲和力/动力学

基因敲除的遗传材料的分析,发现GPR54抑制Src激酶的磷酸化水平。那么,科研人员猜想,Kp-10刺激Gpr54后是否会招募一个磷酸酶来降低Src激酶的磷酸化水平?通过质谱分析发现了三个高潜力的磷酸酶DUSP18、PTPN6和PPP1CA。Biacore、CO-IP等结果显示,GPR54的C端与人源DUSP18磷酸酶、鼠源DUSP18磷酸酶均能结合,亲和力KD分别为40.27 nM和1.754 μM(图3)。综合以上结果表明,GPR54的C段在其配体Kp-10刺激下同时招募DUSP18磷酸酶和Src激酶。
图2:Biacore检测GPR54与Src激酶结合的亲和力/动力学

图3:Biacore检测GPR54与人源DUSP18(左)、鼠源DUSP18磷酸酶(右)结合的亲和力/动力学

进一步,科研人员通过Biacore还发现,DUSP18磷酸酶与与Src激酶也能直接结合,亲和力KD高达5.887 nM(图4)。因此,GPR54的C段在其配体Kp-10刺激下,同时招募DUSP18磷酸酶和Src激酶,促进DUSP18磷酸酶对Src激酶的去磷酸化,从而抑制Src激酶的磷酸化水平。至此,科研人员发现了整个信号通路,为治疗破骨细胞相关骨质流失找到了有效治疗靶点。
图3:Biacore检测ATAD3A与PERK的相互作用

图4:Biacore检测DUSP18磷酸酶与Src激酶结合的亲和力/动力学

当前骨质疏松最主流的治疗手段为通过靶向阻断RANK和RANKL的结合来抑制破骨细胞的活性,该合作团队早在2016年同样发表了关于骨质疏松症的研究论文,其工作发表在医学顶级期刊Nature Medicine上,题为“LGR4 is a receptor for RANKL and negatively regulates osteoclast differentiation and bone resorption”。本研究首次发现破骨细胞中最重要分化因子RANKL的一个新受体LGR4。Biacore为RANKL新受体的发现与确认提供了核心数据。

科研人员通过Biacore发现,全长LGR4胞外域与RANKL能够结合,并且亲和力KD高达52.2 nM。截短的LGR4胞外域与RNKL的结合明显减弱,KD为1.527 μM。而进一步截短的LGR4胞外域与RNKL不结合(图5)。表明,LGR4与RANKL直接结合,且完整的LGR4胞外域对于其与RANKL结合至关重要。在四个骨质疏松症小鼠模型中, LGR4-ECD处理后,降低了破骨细胞活性并增加了骨密度。因此,LGR4-ECD在体外和体内充当RANKL的分子诱饵受体,并抑制RANKL诱导的破骨细胞活化和骨质流失,从而有效改善骨质疏松症。

表 1,多肽类候选物与靶点 GLP-1R 的亲和力

图5:Biacore检测RANKL与LGR4胞外域(全长、截短、更短)的亲和力/动力学

总结
Biacore作为唯一被中美日等多国药典收录的分子互作检测“金标准”,已广泛应用到基础科研与药物开发的多个领域。截至目前,借助Biacore累计发表的文章已突破60000篇,超过100种的已上市药物的研发、申报、生产过程中也均有Biacore的身影。同样期待越来越多骨科相关疾病的治病机制被发现、药物被开发,造福临床,造福人类。

参考文献:

Li, Zhenxi et al. “Kisspeptin-10 binding to Gpr54 in osteoclasts prevents bone loss by activating Dusp18-mediated dephosphorylation of Src.” Nature communications vol. 15,1 1300. 12 Feb. 2024, doi:10.1038/s41467-024-44852-9
Luo, Jian et al. “LGR4 is a receptor for RANKL and negatively regulates osteoclast differentiation and bone resorption.” Nature medicine vol. 22,5 (2016): 539-46. doi:10.1038/nm.4076