Biacore解码:突破慢性病治疗的天然分子密钥

Biacore解码:突破慢性病治疗的天然分子密钥

Biacore解码:突破慢性病治疗的天然分子密钥

在慢性病治疗这场持久战中,人类从未停止寻找破局密钥。古老医典里沉睡的草本精华,如今正通过Biacore分子互作分析技术焕发新生。

通过Biacore技术的最新研究,科学家成功解析了三大天然成分的分子作用机理。

  1.  Plumbagin通过靶向lncRNA改善肌肉萎缩
  2.  异甘草苷特异性结合TRDMT1缓解心脏毒性
  3.  咖啡因调控Dusp9改善脂肪肝炎

这些发现不仅为难治性疾病带来新希望,更展现了现代生物技术在天然产物研究中的应用价值。

让我们一起见证这场传统与现代交融的科研突破…




Plumbagin抗肌肉萎缩机制




肌肉萎缩作为多种慢性疾病的共同病理特征,目前临床治疗面临重大挑战。

广州中医药大学团队在《Phytomedicine》发表突破性研究,不仅证实骨骼肌卫星细胞分化障碍和NF-κB通路过度激活是肌肉萎缩的关键驱动因素,并且首次阐明中药活性成分Plumbagin通过靶向lncRNA DANCR改善肌肉萎缩的分子机制

研究发现,中药成分Plumbagin通过靶向降解长链非编码RNA DANCR,阻断NF-κB通路激活,从而有效改善肌肉萎缩。

团队利用Biacore技术验证了PB与DANCR的直接结合,SPR分析显示Plumbagin以KD值2.901×10⁻⁵ M的亲和力特异性结合DANCR,为Plumbagin调控NF-κB信号通路提供了直接证据。

Biacore检测Plumbagin与DANCR的结合传感图

图1:Biacore检测Plumbagin与DANCR的结合传感图

Biacore技术验证了Plumbagin通过靶向DANCR降解阻断NF-κB信号通路的激活,从而减轻肌肉萎缩

这一发现不仅为肌肉萎缩提供了新的治疗策略,还创新性地发现了首个靶向lncRNA的天然小分子,建立了RNA靶向药物筛选的新方法,为中药现代化研究提供了技术范式。




异甘草苷改善阿霉素诱导的心肌毒性




阿霉素是常用的抗癌药,常用于化疗,但阿霉素的心脏毒性(30%发生率)和右雷佐生的致癌风险,是当前肿瘤治疗中的重要临床挑战。

异甘草苷(ISL)是从甘草中提取的黄酮类化合物,具有抗氧化、抗炎和抗肿瘤活性。

山东中医药大学团队在《Phytomedicine》发表最新研究,通过Biacore技术证实异甘草苷(ISL)与TRDMT1的特异性结合,为缓解阿霉素(DOX)心脏毒性提供新靶点。

在这项研究中,Biacore 1K被用于验证异甘草苷与m5C甲基转移酶TRDMT1之间的结合特性。研究人员首先通过分子对接实验预测了异甘草苷与TRDMT1的结合位点,并利用Biacore SPR技术进一步实验验证了两者的结合动力学特性。

结果显示,异甘草苷与TRDMT1的结合具有“快上快下”的特性,平衡解离常数(KD)为4.9×10-7 M。这一结果不仅验证了分子对接的预测,还为异甘草苷通过调控TRDMT1改善心肌线粒体自噬提供了直接的实验依据。

Biacore检测异甘草苷与TRDMT1的结合传感图

图2:Biacore检测异甘草苷与TRDMT1的结合传感图

Biacore技术实时监测获得的”快上快下”结合动力学特征,准确反映了异甘草苷与靶蛋白的瞬时作用模式,为后续发现的TRDMT1-m5C-线粒体自噬调控通路奠定了分子基础,使传统中药活性成分的作用机制研究达到现代药理学标准。




咖啡因改善代谢相关脂肪性肝炎机制




代谢相关脂肪性肝病(MASLD)全球患病率达25%,其进展型代谢相关脂肪性肝炎(MASH)可导致肝纤维化甚至肝癌。

目前临床缺乏特效药物,而流行病学显示咖啡因摄入与肝病风险降低显著相关,但具体机制不明。

上海中医药大学附属曙光医院团队近期在《Redox Biology》发表重要成果,利用Biacore技术解析咖啡因(CAFF)改善代谢相关脂肪性肝炎(MASH)的分子机制,为药物靶点发现提供范例。

研究团队通过分子对接预测咖啡因与双特异性磷酸酶9(Dusp9)结合后,采用Biacore T200进行实验验证。研究人员将Dusp9蛋白固定在CM7芯片上,进样不同浓度的咖啡因溶液,实时检测结合和解离过程。

结果显示,咖啡因与Dusp9的结合具有剂量依赖性,亲和力为1.86×10⁻⁴ M。这一结果不仅验证了分子对接的预测,还为咖啡因通过调控Dusp9改善MASH提供了直接的实验依据。

Biacore检测咖啡因与Dusp9的结合传感图

图3:Biacore检测咖啡因与Dusp9的结合传感图

Biacore技术的应用,使研究人员能够突破传统研究方法的局限,首次从分子互作角度解析咖啡因改善脂肪肝的作用机制。

这种高精度、实时动态的检测手段,为天然产物活性成分的靶点发现和机制研究提供了可靠的技术支撑,展现出在代谢性疾病研究领域的重要价值。

结语

从肌肉萎缩到心脏毒性,再到脂肪肝炎,Biacore SPR技术为天然活性成分研究提供了重要技术支撑:

  • 实现了分子互作的实时动态检测;
  • 提供了精确的结合动力学参数;
  • 建立了从靶点发现到机制验证的研究体系;

我们看见的不仅是天然产物的重生,更是一个用技术解码生命、用传统启迪未来的医疗新纪元。

随着更多机制被揭示,我们期待这些源自天然产物,能通过现代科技的“翻译”,为全球患者带来更安全有效的治疗方案

Biacore 助力天然产物研究登顶刊

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Biacore上市三十余年,因其灵敏度高、功能全面、自动化水平高等特性,助力了超过6.5万篇科学论文的发表,应用领域百花齐放。“百花”中,除了经典的动力学/亲和力测定外,药物筛选、竞争性结合、效价测定、构效关系、组装顺序、未知因子发现等相关科研成果也是“花团锦簇”,这些与Biacore实时、无标记、高灵敏、高通量等特点息息相关。今天我们就一起来关注Biacore的样品回收-“垂钓”功能携手传统中医药等研究共同“绽放”的相关成果。

“青蒿素是中医药献给世界的一份礼物!”

提到青蒿素,人们首先会想到它的抗疟疾功用。的确,青蒿素是治疗疟疾耐药性效果最好的药物,以青蒿素类药物为主的联合疗法,也是当下治疗疟疾的最有效最重要手段。但是近年来随着研究的深入,青蒿素其它作用也越来越多被发现和研究,如抗肿瘤、治疗肺动脉高压、抗糖尿病、胚胎毒性、抗真菌、免疫调节等。

多囊卵巢综合征 (PCOS) 是一种常见的生殖内分泌疾病,影响10%至13%的育龄妇女,雄激素过量是导致PCOS表型特征的关键因素。尽管多囊卵巢综合征的患病率很高,但对这种复杂综合征的药物干预遇到了实质性的挑战。目前可用于多囊卵巢综合征的治疗方案是有限的,主要针对特定症状的管理。因此,迫切需要发展创新的治疗策略。

青蒿素调控LONP1-CYP11A1改善PCOS

2024年6月,复旦大学汤其群团队在Science上发表的题为“Artemisinins ameliorate polycystic ovarian syndrome by mediating LONP1-CYP11A1 interaction”的研究论文。该文章主要研究了青蒿素类化合物通过调节LONP1-CYP11A1的相互作用来改善多囊卵巢综合征 (PCOS) 的疗效,揭示了青蒿素类药物在治疗PCOS方面的潜力,并为针对LONP1-CYP11A1相互作用的PCOS干预提供了新的途径。其中就利用Biacore确认了青蒿素的直接作用靶点,阐明了青蒿素对睾酮合成的调控机制。

 

作者团队首先发现青蒿素类似物蒿甲醚在PCOS样啮齿动物模型中表现出明显的改善高雄激素血症、不规则的排卵周期、多囊卵巢形态和低生育能力。通过相对定量的蛋白质组学分析,结果表明CYP11A1是受青蒿素影响最显著的蛋白,该酶催化雄激素合成的初始步骤。

进一步的分子机制研究,考虑到预测的青蒿素结合口袋位于LONP1的蛋白水解结构域内,因此作者制作并纯化了该结构域,并利用Biacore测定了青蒿素与该结构域的结合亲和力。将LONP1的结构域通过无需标记的方式直接全自动偶联在CM5芯片上,青蒿素衍生物ATM(蒿甲醚)、SM934和ATS(青蒿琥酯)作为分析物以流动相的形式依次流过LONP1蛋白结构域。Biacore结果显示,ATM与蛋白水解结构域结合的解离常数 (KD) 为3.11±0.358 µM(图1左),SM934的KD为8.69±0.749 µM(图1中),ATS的KD为0.261±0.029 µM(图1右)。

图1:Biacore从分子水平证明LONP1是青蒿素的直接靶点

图1:Biacore从分子水平证明LONP1是青蒿素的直接靶点

随后的功能实验表明,青蒿素对CYP11A1水平的抑制作用很大程度上依赖于其与LONP1蛋白水解结构域的直接结合。与青蒿素的功能一致,LONP1过表达强烈抑制卵巢雄激素的产生。最后也进行一项临床试验证实了青蒿素对PCOS患者的治疗效果良好。

 

 

 

根据以上研究,本文总结出了青蒿素抑制卵巢雄激素合成,缓解多囊卵巢综合征的分子机制(图2)。促雄激素诱导剂人绒毛膜促性腺激素 (hCG) 破坏LONP1和CYP11A1之间的相互作用,导致CYP11A1上调,从而促进雄激素产生,加重PCOS。相反,青蒿素介导LONP1-CYP11A1相互作用,促进CYP11A1降解,进而抑制卵巢雄激素合成。因此,青蒿素在啮齿类动物和人类患者中均显示出改善多囊卵巢综合征症状的功效。

图2:青蒿素抑制卵巢雄激素合成,缓解多囊卵巢综合征

图2:青蒿素抑制卵巢雄激素合成,缓解多囊卵巢综合征

小 结

综上所述,Biacore作为中医药研究领域的强有力工具,期待其具备的众多优势特征与各位中医药研究者再接再厉,助力中医药研究更上一层楼。

  • 超高灵敏度检测;
  • 无分子量检测下限;
  • 对于小分子的结合位点在蛋白口袋中的分子也依然可以进行高灵敏度的直接检测;
  • 具备溶剂矫正功能对需要有机溶剂助溶的小分子测得精准的相互作用结果。

参考文献:

[1]. Liu Y, Jiang JJ, Du SY, Mu LS, Fan JJ, Hu JC, Ye Y, Ding M, Zhou WY, Yu QH, Xia YF, Xu HY, Shi YJ, Qian SW, Tang Y, Li W, Dang YJ, Dong X, Li XY, Xu CJ, Tang QQ. Artemisinins ameliorate polycystic ovarian syndrome by mediating LONP1-CYP11A1 interaction. Science. 2024 Jun 14;384(6701):eadk5382.

 

毒蛇不再可怕 | Biacore助力抗蛇毒广谱抗体的开发

毒蛇不再可怕 | Biacore助力抗蛇毒广谱抗体的开发

毒蛇不再可怕 | Biacore助力抗蛇毒广谱抗体的开发

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全球每年有超过580万人存在遭遇毒蛇的风险,有近270万人因蛇咬伤而入院,其中约10万因此丧生,另有约40万人被迫截肢或落下终身残疾。蛇咬伤主要发生在热带和亚热带地区的发展中国家,仅在印度,每年就有多达280万人被蛇咬伤,其中有约4.6万人死亡(数据来源:联合国官网)。

Biacore为抗蛇毒广谱抗体开发强势助力让毒蛇不再可怕

人们针对蛇咬伤的主要治疗方法一直是使用来自免疫动物血液的多克隆抗体混合物。虽然它们被证明是有效的治疗方法,但这些药物的安全性较差、一致性不高以及存在副作用等问题。因此,寻找治疗严重蛇咬伤毒液的新方法正在进行中。随着技术的发展,科学家发现人源化广谱中和单克隆抗体以其卓越的安全性和超高的中和能力,明显优于传统的治疗手段。

2023年2月8日,权威期刊Nature Communications在线发表了丹麦技术大学、苏黎世联邦理工学院,哥斯达黎加大学以及工业合作伙伴Sophion Bioscience和IONTAS等科研团队题为“Discovery and optimization of a broadly-neutralizing human monoclonal antibody against long-chain α-neurotoxins from snakes”的最新研究成果(图1)。该团队将基于噬菌体展示的交叉平移、Biacore等多种技术相结合,对亲本抗体进行设计优化,同时提升了其对α神经毒素的亲和力,以及对多种蛇毒液来源的α神经毒素交叉中和能力。这种抗体有助于设计未来的毒液疗法,为患者带来希望。

图1:丹麦技术大学等发表在Nature Communications上的科学研究论文

该团队先前获得了一种针对眼镜蛇孟加拉亚种来源的α-神经毒素的单克隆抗体368_01_C05。这种抗体尽管未能防止致死,但可以有效延长注射致死剂量眼镜蛇来源的α-神经毒素的小鼠存活期。经过基于噬菌体展示的交叉平移技术,研究人员获得了6个排名靠前的能够同时结合α-眼镜蛇毒素和α-鳞蛤毒素的抗体。为进一步验证,获得的6个抗体与眼镜蛇来源的α-神经毒素的亲和力是否提高。研究人员使用Biacore技术,直接检测了获得的这6个抗体及其亲本抗体与眼镜蛇来源的α-神经毒素的亲和力,结果表明,相较于亲本抗体,六种抗体对该毒素的亲和力均提升10倍以上,达到nM级别。其中,2551_01_A12、2554_01_D11和2558_O2_G09提升最多,均在30倍以上(图2,表1)。

图2:Biacore检测6个抗体及其亲本抗体与眼镜蛇来源的α-神经毒素的亲和力

研究人员进一步使用Biacore技术,检测了这6个抗体及其亲本抗体黑曼巴蛇来源的α-神经毒素的结合情况,结果表明,相较于亲本抗体,六种抗体对该毒素的亲和力均提升4倍以上,达到nM级别。其中,2551_01_A12和2554_01_D11提升最多,均在8倍以上(图3,表1)。

图3:Biacore检测6个抗体及其亲本抗体与黑曼巴蛇来源的α-神经毒素的亲和力

因此,根据Biacore亲和力与交叉反应性的结果(表1)以及抗体表达产量与可开发性数据,选择2551_01_A12抗体和抗体2554_01_D11进行进一步表征。

表1:Biacore检测6个抗体及其亲本抗体与两种毒素的亲和力与动力学

通过MS等技术发现,抗体2554_01_D11还能与眼镜王蛇、森林眼镜蛇等来源的α-神经毒素结合。Biacore实验,还发现抗体2554_01_D11能与银环蛇来源的α-神经毒素结合(图4)。结合中和性实验结果,最终选择的抗体2554_01_D11,能够结合广泛的蛇来源的神经毒素,并且具有更强的亲和力与中和作用。

图4:Biacore检测抗体2554_01_D11与银环蛇来源的α-神经毒素结合

Biacore作为唯一被中美日等多国药典收录的分子互作检测“金标准”,已广泛应用到基础科研与药物开发的多个领域。截至目前,借助Biacore累计发表的文章已突破55,000篇,超过80%的已上市的抗体药物的研发、申报、生产过程中也均有Biacore的身影。相信有了Biacore助力“产学研”,未来一定会有越来越多的中和抗体药物从研发走向上市。期待抗蛇毒单克隆抗体的顺利上市,让毒蛇不再可怕!

Biacore,for a better life

神奇的蜗牛丨Biacore揭示蜗牛多糖的生物学活性

神奇的蜗牛丨Biacore揭示蜗牛多糖的生物学活性

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说到蜗牛大家并不会感到陌生,这种小生物在爬行时会从体内分泌出一种黏液,其高黏性可以让蜗牛爬行和栖息在潮湿的岩石或树木上。近年来科学家发现这种自然界中生物的粘附现象对医用仿生材料的研发具有重要的借鉴和启发意义,蜗牛黏液这种天然黏附特性和不明显的生物活性,可能是一种潜在的伤口修复天然生物粘合剂
在伤口管理中外科缝合仍然是重新连接受伤组织的金标准,但具有疼痛、缝合部位感染以及皮肤疤痕等问题。近年来新型的生物粘合剂表现出优越的机械性能和功能,却仍然缺乏湿粘接能力和生物相容性。2023年1月,中科院昆明植物研究所吴明一团队在Nature Communications上发表题为“A natural biological adhesive from snail mucus for wound repair”的研究论文,报道了从从蜗牛粘液中发现的一种天然多糖基粘合剂d-SMG(dried Snail Mucus Gel),对湿润组织具有较强的粘附性能,优于临床使用的纤维蛋白胶。

图1. d-SMG在伤口愈合中的作用机制
图1. d-SMG在伤口愈合中的作用机制

d-SMG主要由类肝素的蜗牛糖胺聚糖与蜗牛蛋白质等生物大分子组成,动物实验表明d-SMG能显著加快慢性伤口的肉芽组织新生、血管新生以及胶原沉积,改善慢性伤口的炎症微环境。新型糖胺聚糖(s-GAG)为其有效活性组分,主要通过结合炎症细胞因子下调组织中TNF-α、IFN-γ、IL-6的表达水平(图1)。

如何在分子水平上确认s-GAG与细胞因子的结合?和肝素相比,是否可以定量比较结合能力的强弱?Biacore实验表明,与Heparin一样,s-GAG可以直接结合包括TNF-α、IL-6、IL-8、IP-10在内的多种炎症细胞因子(图2),从定量数据上可以看出,s-GAG和Heparin与各种细胞因子的亲和力数值相近(表1)。

图2. Biacore检测s-GAG/Heparin与细胞因子的亲和力
图2. Biacore检测s-GAG/Heparin与细胞因子的亲和力

表1. s-GAG/Heparin与各类细胞因子的亲和力
表1. s-GAG/Heparin与各类细胞因子的亲和力

其实该团队在2020年发表的题为“A non-anticoagulant heparin-like snail glycosaminoglycan promotes healing of diabetic wound”的文章中就已经报道了这种新型糖胺聚糖s-GAG在临床难治愈的糖尿病足溃疡(Diabetic foot ulcer, DFU)中的临床应用前景。

在这篇文章中,研究人员同样采用Biacore检测了s-GAG与细胞因子CLCX8的结合,如图3所示,两者的亲和力KD= 19.5 ± 3.4 μM,比Heparin的亲和力更强。通过Biacore定量数据可以看到,s-GAG解聚后的产物(dSG-1/dSG-2/dSG-3/dSg-4)与CLCX8的亲和力也有不同程度的下降,表明s-GAG具有更强的抗炎活性。

图3. Biacore检测s-GAG/Heparin与CLCX8的结合
图3. Biacore检测s-GAG/Heparin与CLCX8的结合

大自然的神奇正是如此,这种蜗牛中提取的新型糖胺聚糖s-GAG表现出优异的止血性能、生物相容性和生物降解性,能够显著加速慢性伤口的愈合,对新一代生物医用粘合剂的开发具有重要意义,这也为普通皮肤伤口以及临床难治愈的糖尿病足溃疡等皮肤疾病的治疗提供了一种新思路,为天然来源的糖类创新药物的研发奠定了基础。

Biacore作为互作领域的“金标准”,对于多糖类样本的分析也能轻松应对,能够快速获得亲和力的定量数据。凭借高质量的数据和广泛的应用,为不同领域的科学研究提供精准的数据,助力超过五万篇文献的发表,成为发表高分文章的必备工具。

参考文献:

1. Deng, Tuo et al. “A natural biological adhesive from snail mucus for wound repair.” Nature communications vol. 14,1 396. 24 Jan. 2023, doi:10.1038/s41467-023-35907-4

2. Wu, YueboZhou, ZhipengLuo, LanTao, MaixianChang, XiaoYang, LianHuang, XingyongHu, LinWu, Mingyi. A non-anticoagulant heparin-like snail glycosaminoglycan promotes healing of diabetic wound[J]. Carbohydrate Polymers: Scientific and Technological Aspects of Industrially Important Polysaccharides, 2020, 247(1).