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Biacore耗材选择保姆级攻略,一次配齐安心上机!(上)

1 月 14, 2025

Biacore是一种基于光学表面等离子共振原理(Surface Plasmon Resonance,SPR),用于分子互作分析的实验方法,其基本流程包含固定配体、分析物进样、芯片再生和数据分析。

当我们拥有一台Biacore仪器,需要做一对分子的互作分析时,如何根据互作分子的特性去选择芯片、缓冲液、各类试剂盒等耗材,是上机前必须解决的问题!

图1:Biacore实验的基本流程

传感芯片是Biacore实验最核心部件之一,Biacore拥有丰富的芯片家族,如CM5、CM7、CM4、CM3、PEG、C1、SA、NA、CAP、NTA、L1、HPA、Protein A/G/L 、PrismA和裸金芯片等17种芯片。
不同类型的芯片,其表面性质有所不同,适用范围包括蛋白质 – 蛋白质、蛋白质 – 核酸、蛋白质 – 小分子化合物、抗原 – 抗体等多种相互作用的检测和分析,在蛋白质组学、药物研发、免疫研究等领域发挥着重要作用。

 友情提示:

Biacore传感芯片分为两个系列,分别是“经典”传感芯片(Classic)和“S系列”传感芯片(Series S),二者的区别是芯片外壳形状不同,对应的Biacore机型不同,不符合机型的芯片无法插入仪器进行使用哦~

  • “S 系列”传感器芯片适用于Biacore 1K、1K+、1S+、8K+、8K、S200、T200 和4000系统;
  • “经典”传感芯片适用于Biacore X100、3000 和C系统;
我们称被固定或捕获在传感芯片上的分子为“配体”,流经芯片表面的分子为“分析物”。如何选择芯片,芯片之间有什么区别,多种实验方案如何选择,不同芯片固定或捕获配体过程中需要哪些试剂盒,接下来小编就带你一起看看吧~

蛋白、肽段、糖类、小分子

当一对互作分子其中有一个分子是蛋白、肽段、糖类、小分子,那么90%的互作都可以选择CM系列芯片,包含CM5、CM7、CM4、CM3。其具有羧基化葡聚糖表面,当配体带有-NH2,-SH,-CHO,-OH,-COOH基团,即可通过共价偶联的方式固定在芯片表面。通过共价偶联的配体无法再从芯片上分离下来,是不可逆的固定。

  • CM5和CM7芯片:CM5芯片是蛋白质偶联的第一选择,在此基础上,CM7芯片的葡聚糖链更长,羧甲基含量更高,因此可以实现更高的偶联量,更加适用于蛋白和小分子的互作。当蛋白和小分子之间分子量比大于200时,建议选择CM7芯片。
  • CM3和CM4芯片:这两种芯片的固定水平通常约为CM5芯片固定水平的30%左右,CM4芯片羧基化程度低于CM5芯片,即携带的负电荷相对较少,能减少对带高正电荷蛋白的非特异性结合,易得到较低的Rmax,便于进行动力学研究,可用于检测蛋白、蛋白复合体或细胞裂解液等样品。CM3芯片与CM5芯片的羧基化程度相同,但葡聚糖链长度比CM5短,降低了空间位阻,适用于低偶联量的互作分析,以及分析物为大分子、颗粒物的互作,例如细胞、病毒和分子复合物。

图2:CM7、CM5、CM4、CM3芯片表面结构示意图

细胞、病毒等大分子颗粒

除去上文提到的CM3芯片,还可以运用C1和PEG芯片完成如细胞、病毒等大分子、 分子复合物、多价体和分子颗粒的互作。

  • C1芯片:芯片是羧基表面,无葡聚糖支链,能避免葡聚糖链引起的空间位阻,其固定水平通常约为CM5芯片的10%。但是由于C1芯片表面的亲水性低于CM5传感芯片,这可能会导致某些样品的非特异性结合增加。
  • PEG芯片:芯片是带有羧基平铺的聚乙二醇表面,无葡聚糖支链,最大的特点是具有超低的非特异性吸附。通常它的固定量为1000 Ru左右,说明书中有固定的氨基共价偶联条件,不需要做pH scouting。
以上提到的所有芯片(CM5、CM7、CM4、CM3、C1、PEG)都可以通过氨基偶联、醛基偶联、巯基偶联、马来亚酰胺偶联等方法将配体固定在芯片上。
由于芯片表面带负电(pK=3.5),Biacore提供pH 4.0-5.5的醋酸钠偶联缓冲溶液用于稀释配体分子使其带正电(偶联缓冲溶液pH值需小于配体分子等电点),以完成配体分子的预富集。在正式偶联之前建议进行pH scouting,挑选满足静电吸附且温和的pH预富集条件。
Biacore提供两种直接共价偶联的试剂盒,分别是氨基偶联试剂盒和巯基偶联试剂盒。一个氨基偶联试剂盒至少可以完成100次偶联,一个巯基偶联试剂盒可以完成30-50次的偶联,且具有单独的PDEA补充试剂盒。

带标签分子

针对一些具有“特殊身份”的配体分子,Biacore提供多种固定方案可供选择。

His标签的分子作为配体有三种固定方式:
  • CM系列芯片+氨基偶联试剂盒:直接随机不可逆的共价偶联His标签分子,适用于分析物配体分子量差距大,需要高固定量的蛋白和小分子互作。
  • CM系列芯片+氨基偶联试剂盒+His捕获试剂盒:需要运用氨基偶联试剂盒将抗His抗体共价固定在芯片上,再通过抗His抗体捕获带His标签配体分子,相当于自制的捕获芯片,具有配体固定的定向性。可以通过再生步骤,更换不同的His标签蛋白,实现可逆的固定。His捕获试剂盒带有固定缓冲液和再生试剂,省去了优化固定和再生条件的步骤,适用于偶联量不高但对配体固定稳定性有一定要求的互作。
  • NTA芯片+NTA试剂盒:NTA芯片在羧基化葡聚糖表面包被氨三乙酸(NTA),通过金属离子螯合作用可以捕获带His标签的配体分子,捕获量可以达到3000-4000 Ru。NTA芯片的优势在于可以多次捕获不同的带His标签蛋白,实现可逆的固定,无需自己固定抗His抗体。NTA试剂盒中配有螯合试剂(0.5mM NiCl2)和再生试剂(350mM EDTA),省去条件优化的步骤。
    另外,NTA芯片带有未修饰的羧甲基,同样可用于共价固定,其方式与CM系列芯片相同,偶联量同CM5。如果通过金属螯合法捕获的配体不够稳定,则可以在镍注射后和配体注射之前用氨基偶联试剂活化芯片表面,这种方法可以增加His标签分子配体的捕获量和稳定性。捕获配体的方法适用于蛋白等电点低,低pH条件下不稳定,无法通过静电吸附进行预富集的蛋白样品,详见下图。

图3:如何选择共价偶联和捕获

生物素标签的分子作为配体有三种固定方式:
对于核酸、糖类、多肽等不利于常规偶联的样品,可以通过试剂盒添加生物素标签,再被捕获到SA、NA或CAP芯片表面,捕获完配体后不用进行封闭,可直接上分析物进行分析。

表1:生物素标签分子的3种固定方式

CAP芯片是通过在链霉亲和素上连接一段寡聚核苷酸,形成生物素捕获分子,通过核酸互补配对与芯片连接,如图4所示。CAP芯片不单独售卖,仅提供Biotin CAPture 捕获试剂盒,该试剂盒中含有CAP芯片、生物素捕获试剂与再生试剂,生物素捕获试剂可另外单独购买。

图4:SA、NA、CAP芯片表面结构示意图

GST标签的分子作为配体的固定方式:
  • CM系列芯片+氨基偶联试剂盒+GST捕获试剂盒:需要运用氨基偶联试剂盒将抗GST抗体共价固定在芯片上,再捕获带GST标签配体分子,试剂盒中还包含了重组GST,可以作为阳性对照或竞争性抑制剂

抗体类分子

抗体作为配体有多种固定方式:
  • Protein A/G/L芯片:羧基化的葡聚糖表面共价偶联Protein A/G/L蛋白,Protein A/G芯片只结合抗体Fc区,保证了抗体结合的定向性。Protein L可结合抗体片段,如Fabs、scFv、dAbs,抗体结合范围比Protein A/G更宽泛。关于Protein A/G/L对不同种属抗体亚型的亲和力强弱,请扫描文末二维码查看~
  • CM系列芯片+氨基偶联试剂盒+抗体捕获试剂盒:需要运用氨基偶联试剂盒先将对应抗抗体共价固定在芯片上,再捕获对应抗体。Biacore提供鼠抗、人抗、人Fab片段捕获试剂盒,当Protein A/G/L与某种抗体的亲和力弱导致芯片捕获量低,或抗体样品不纯,成分复杂时,例如使用牛血清为培养基表达产生的鼠源抗体或抗体片段,建议使用抗体捕获试剂盒提高捕获的特异性和稳定性。也可以在CM系列芯片上自己固定对应的抗抗体制成捕获芯片。
  • PrismA芯片(S系列):羧基化的葡聚糖表面共价偶联改造的耐碱Protein A蛋白(与Mabselect PrismA填料配基一致),对重链VH3的亲和力增强,结合多种哺乳动物的抗体,推荐用于抗体滴度和浓度测量

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针对抗原抗体互作分析,一般建议固定抗体为配体,抗原作为分析物并控制Rmax<100 Ru。当由于某些原因只能固定抗原为配体时,为避免抗体作为分析物出现“舞蹈效应”造成难以解离的情况,会建议更低水平的偶联,并控制Rmax<30 Ru

脂质分子

  • HPA芯片:芯片具有疏水性烷烃硫醇涂层,无葡聚糖基质,囊泡或脂质体可吸附至表面形成脂质单层,疏水端朝向金膜,亲水端朝向水溶液样品,适用于脂质单分子层和膜结合蛋白的相互作用。
  • L1芯片:芯片表面在葡聚糖基质载有疏水结构,可插入脂质体,从而将膜吸附于葡聚糖基质,适于研究跨膜受体蛋白在膜环境内的相互作用。

两种芯片最主要的区别是:脂质体或囊泡在HPA芯片上形成脂单分子层,不适合固定嵌入膜结构较深的膜蛋白或者跨膜蛋白;L1芯片则可以支持脂双层结构的形成,可用于固定完整膜结构中的配体。另外,有关于膜蛋白的互作研究,也可以单独表达膜蛋白互作区域,用CM系列芯片固定膜蛋白,需要在缓冲体系中加入一定量的去垢剂促溶。

图5:L1芯片表面结构示意图

特殊分子量身定制

  • 裸金芯片试剂盒:包含10个裸金传感器表面和芯片支架,以及组装工具包和配件,具有未经处理的金膜表面,用于设计和创建独特的表面化学修饰。